Das Dorf entstand im Laufe des 9. Jahrhunderts als Abhängigkeit von der Ausstattung der Abtei Murbach. Villars-le-Sec gehörte bis 1698 zur Pfarrei Saint Dizier l'Évêque und unterstand der Vogtei und der Herrschaft von Delle (an die Mazarins). Im Jahr 1803 lebten 140 Einwohner im Dorf. Im Jahr 1829 wurde die der Geburt der Jungfrau Maria gewidmete Kirche gebaut und das Dorf wurde zu einer eigenständigen Pfarrei. Der Bau des Glockenturms und die Vergrößerung der Kirche wurden 1867 durchgeführt.
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