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Musée de la Lunette HAUTS DE BIENNE
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Centre d'Art d'Audincourt - Donation Patt AUDINCOURT
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Musée de la Tournerie LAVANS-LES-SAINT-CLAUDE
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Ecomusée Les Outils d'Autrefois ARINTHOD
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Musée de la Cave de la Ville Haute PAYS-DE-CLERVAL
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Le Prieuré de Mouthier Haute-Pierre MOUTHIER-HAUTE-PIERRE
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Musée la Maison Vigneronne d'Autrefois ROUGEMONT
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La Grande Saline de Salins-les-Bains SALINS-LES-BAINS
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Musée du Ski et de la Tradition Rousselande LES ROUSSES
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Musée de l'Espace des Mondes Polaires Paul-Émile Victor PREMANON
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Musée municipal d'Art et d'Histoire PONTARLIER
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Musée de la Résistance et de la Déportation de l'Ain NANTUA
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Musée de la Résistance et de la Déportation - Citadelle de Besançon BESANCON
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Musée de la Vigne et du Vin du Jura ARBOIS
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Musée de la mode du 18ème 19ème siècle ORGELET
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Musée de la Meunerie de Métabief METABIEF
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La Fabrique du Chocolat ORNANS
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Musée de la Taillanderie NANS-SOUS-SAINTE-ANNE
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Musée de la Paysannerie et des Vieux Métiers VALENTIGNEY
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Musée "Mémoires d'Autrefois" AMBRONAY
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Apothicairerie de Poligny POLIGNY
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Fromagerie-Musée TREPOT
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Musée Bost et de l'outil LAISSEY
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La Maison de la Flore LONGCHAUMOIS